Antarctic Microbial Biodiversity(AMBIO) samples

サンプリング イベント
最新バージョン University of Liège により出版 7月 25, 2022 University of Liège
公開日:
2022年7月25日
ライセンス:
CC-BY 4.0

DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード:

DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 13 レコード English で (12 KB) - 更新頻度: unknown
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RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (10 KB)

説明

This dataset describe sampling events for the BelSPO project Antarctic Microbial Biodiversity (AMBIO) project which aims to determine the microbial diversity in Antarctic aquatic ecosystems, using an integrated and standardised analysis. The samples, collected between 1997 and 2007, were further analysed with metabarcoding techniques during the CCAMBIO project. eDNA derived occurrences to be published in sibling datasets.

データ レコード

この sampling event リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、13 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは1 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

Event (コア)
13
MeasurementOrFacts 
195

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は University of Liège。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 418344a0-efe7-41c2-9729-6341a53e7cb4が割り当てられています。   Belgian Biodiversity Platform によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているUniversity of Liège が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Samplingevent

連絡先

Annick Wilmotte
Igor Pessi
  • 最初のデータ採集者
  • PhD Postdoctoral Researcher
University of Helsinki
FI
André Heughebaert
  • メタデータ提供者
  • IT manager
Belgian Biodiversity Platform
BE
Annick Wilmotte
  • 研究代表者
  • Senior Research Associate (Life Sciences)
University of Liege
  • Allée du 6 aout, 13
4000 Liège
BE
  • +3243663387
Annick Wilmotte
  • 研究代表者
University of Liege
BE
Wim Vyverman
Gent University Protistologie en Aquatische Ecologie (PAE)
BE
Anne Willems
Gent University Laboratorium voor Microbiologie (LM-Gent)
BE

地理的範囲

Antarctic continent

座標(緯度経度) 南 西 [-90, -180], 北 東 [-60, 180]

生物分類学的範囲

all sort of microorganisms

Domain Bacteria
Phylum Cyanobacteria

時間的範囲

開始日 / 終了日 1997-01-01 / 2007-12-31

プロジェクトデータ

AMBIO, and CCAMBIO, Antarctic Microbial Biodiversity projects aim to determine the microbial diversity in Antarctic aquatic ecosystems, using an integrated and standardised analysis. See CCAMBIO [website](http://www.ccambio.ulg.ac.be/?page=home) and [final report] (https://www.belspo.be/belspo/SSD/science/Reports/CCAMBIO_FinRep.pdf).

タイトル Antarctic Microbial Biodiversity: importance of geographical and ecological factors
識別子 (CC)AMBIO
ファンデイング BELSPO

プロジェクトに携わる要員:

Annick Wilmotte

収集方法

In Mago Lake, surface sediments were sampled at a depth of 5.8m using a UWITEC gravity corer (UWITEC, Mondsee, Austria). In the remaining lakes, samples were taken in the littoral zone at ca. 20 cm depth and ca. 40 cm from the lake edge, by manually collecting microbial mats attached to rocks and gravel. All samples were kept frozen (−20◦C) until analysis (Pessi et al. 2018). In the Larsemann Hills, for lake LH59b when no ice cover was present (lakes <2 m deep), samples were taken between 0.5 and 1 m in the littoral zone. All samples were frozen until analysis and stored in the dark (Sabbe et al.2004). For Rauer2, live samples of microbial mat (including cyanobacteria, diatoms and other micro algae) were collected from the littoral zone of the lake and stored under light in sterile culture tubes containing growth media. Samples of microbial mats were also frozen for use in community composition studies (Hodgson et al. 2001). For Forlidas pond, biological material was collected manually from lake littoral. Samples for microscopic investigation were preserved in Lugol’s iodine solution or ethanol and those for molecular analysis were frozen. All sampling equipment was scrubbed with Virkon multi-purpose disinfectant before use, and subsamples were collected in sterile WhirlPak bags or acid-washed bottles (Hodgson et al. 2010). For Lutzow-Holm Bay, sediment cores were extracted using a UWITEC gravity corer for surface sediments (Verleyen et al. 2017)

Study Extent The lake samples came from 5 regions of Antarctica - Eastern Antarctica: Larsemann Hills, Broknes Peninsula (L59b) and Fiilla Island (Rauer2) - Eastern Antarctica: Vestfold Hills (Highway, Waterfall) and Bunger Hills (M5) - Transantarctic Mountains: Forlidas Valley in Dufek Massif (Forlidas pond) and Shackleton Range (Lundström lake) - Antarctic Peninsula: Horseshoe Island (Col1 lake) - Lützow-Holm Bay: West Ongul, East Ongul, Langhovde, Skarvsness,
Quality Control The samples were taken as sterily as possible.

Method step description:

  1. See publications: Sabbe et al. 2004 10.1111/j.1365-2427.2004.01186.x. Hodgson et al. 2001 https://doi.org/10.1017/S0954102001000372 Hodgson et al. 2010 doi:10.1016/j.polar.2010.04.003 Verleyen et al. 2017 http://dx.doi.org/10.1016/j.quascirev.2017.06.003 Pessi et al. 2018 doi: 10.1093/femsec/fiy042

追加のメタデータ

目的

This dataset only covers the geographical, temporal and environmental data of the samples. Occurrences datasets, derived from the analysis of these Antarctic samples, are expected to be published in sibling datasets and will refer to the samples published here.

代替識別子 https://ipt.biodiversity.be/resource?r=ccambio