Antarctic Microbial Biodiversity(AMBIO) samples

Sampling event
Последняя версия опубликовано University of Liège июл. 25, 2022 University of Liège
Дата публикации:
25 июля 2022 г.
Опубликовано:
University of Liège
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 13 Записи в English (12 KB) - Частота обновления: неизвестно
Метаданные в формате EML Скачать в English (11 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (10 KB)

Описание

This dataset describe sampling events for the BelSPO project Antarctic Microbial Biodiversity (AMBIO) project which aims to determine the microbial diversity in Antarctic aquatic ecosystems, using an integrated and standardised analysis. The samples, collected between 1997 and 2007, were further analysed with metabarcoding techniques during the CCAMBIO project. eDNA derived occurrences to be published in sibling datasets.

Записи данных

Данные этого sampling event ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 13 записей.

Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Event (core)
13
MeasurementOrFacts 
195

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является University of Liège. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 418344a0-efe7-41c2-9729-6341a53e7cb4.  University of Liège отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Belgian Biodiversity Platform.

Ключевые слова

Samplingevent

Контакты

Annick Wilmotte
  • Principal Investigator
  • Senior Research Associate (Life Sciences)
University of Liege
BE
Igor Pessi
  • Originator
  • PhD Postdoctoral Researcher
University of Helsinki
FI
André Heughebaert
  • Metadata Provider
  • IT manager
Belgian Biodiversity Platform
BE
Annick Wilmotte
  • Principal Investigator
  • Senior Research Associate (Life Sciences)
University of Liege
  • Allée du 6 aout, 13
4000 Liège
BE
  • +3243663387
Annick Wilmotte
  • Principal Investigator
University of Liege
BE
Wim Vyverman
Gent University Protistologie en Aquatische Ecologie (PAE)
BE
Anne Willems
Gent University Laboratorium voor Microbiologie (LM-Gent)
BE

Географический охват

Antarctic continent

Ограничивающие координаты Юг Запад [-90, -180], Север Восток [-60, 180]

Таксономический охват

all sort of microorganisms

Domain Bacteria
Phylum Cyanobacteria

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 1997-01-01 / 2007-12-31

Данные проекта

AMBIO, and CCAMBIO, Antarctic Microbial Biodiversity projects aim to determine the microbial diversity in Antarctic aquatic ecosystems, using an integrated and standardised analysis. See CCAMBIO [website](http://www.ccambio.ulg.ac.be/?page=home) and [final report] (https://www.belspo.be/belspo/SSD/science/Reports/CCAMBIO_FinRep.pdf).

Название Antarctic Microbial Biodiversity: importance of geographical and ecological factors
Идентификатор (CC)AMBIO
Финансирование BELSPO

Исполнители проекта:

Annick Wilmotte

Методы сбора

In Mago Lake, surface sediments were sampled at a depth of 5.8m using a UWITEC gravity corer (UWITEC, Mondsee, Austria). In the remaining lakes, samples were taken in the littoral zone at ca. 20 cm depth and ca. 40 cm from the lake edge, by manually collecting microbial mats attached to rocks and gravel. All samples were kept frozen (−20◦C) until analysis (Pessi et al. 2018). In the Larsemann Hills, for lake LH59b when no ice cover was present (lakes <2 m deep), samples were taken between 0.5 and 1 m in the littoral zone. All samples were frozen until analysis and stored in the dark (Sabbe et al.2004). For Rauer2, live samples of microbial mat (including cyanobacteria, diatoms and other micro algae) were collected from the littoral zone of the lake and stored under light in sterile culture tubes containing growth media. Samples of microbial mats were also frozen for use in community composition studies (Hodgson et al. 2001). For Forlidas pond, biological material was collected manually from lake littoral. Samples for microscopic investigation were preserved in Lugol’s iodine solution or ethanol and those for molecular analysis were frozen. All sampling equipment was scrubbed with Virkon multi-purpose disinfectant before use, and subsamples were collected in sterile WhirlPak bags or acid-washed bottles (Hodgson et al. 2010). For Lutzow-Holm Bay, sediment cores were extracted using a UWITEC gravity corer for surface sediments (Verleyen et al. 2017)

Охват исследования The lake samples came from 5 regions of Antarctica - Eastern Antarctica: Larsemann Hills, Broknes Peninsula (L59b) and Fiilla Island (Rauer2) - Eastern Antarctica: Vestfold Hills (Highway, Waterfall) and Bunger Hills (M5) - Transantarctic Mountains: Forlidas Valley in Dufek Massif (Forlidas pond) and Shackleton Range (Lundström lake) - Antarctic Peninsula: Horseshoe Island (Col1 lake) - Lützow-Holm Bay: West Ongul, East Ongul, Langhovde, Skarvsness,
Контроль качества The samples were taken as sterily as possible.

Описание этапа методики:

  1. See publications: Sabbe et al. 2004 10.1111/j.1365-2427.2004.01186.x. Hodgson et al. 2001 https://doi.org/10.1017/S0954102001000372 Hodgson et al. 2010 doi:10.1016/j.polar.2010.04.003 Verleyen et al. 2017 http://dx.doi.org/10.1016/j.quascirev.2017.06.003 Pessi et al. 2018 doi: 10.1093/femsec/fiy042

Дополнительные метаданные

Цель

This dataset only covers the geographical, temporal and environmental data of the samples. Occurrences datasets, derived from the analysis of these Antarctic samples, are expected to be published in sibling datasets and will refer to the samples published here.

Альтернативные идентификаторы https://ipt.biodiversity.be/resource?r=ccambio